Кишечные бактерии, вызывающие заболевания, могут скрываться в «секретных» линиях

До сих пор исследования микробиома опирались на классификацию бактерий по видам: считалось, что изменения численности вида напрямую связаны с заболеваниями человека.

Однако новая научная работа показывает, что ключевую роль играют не виды, а скрытые генетические линии внутри них.

Как проводилось исследование

Учёные из Венского университета использовали метод обратной экологии, анализируя геномы бактерий вместо традиционной классификации по видам. Результаты опубликованы в журнале Nature.

Подход позволил выявить ранее незаметные подгруппы бактерий, которые ведут себя по-разному внутри одного и того же вида.

Что скрывается внутри одного вида

Бактерии с одинаковым названием могут иметь разные генетические адаптации, занимать различные участки кишечника и реагировать на разные факторы среды. Поэтому усреднённые данные по виду часто скрывают реальные биологические различия, важные для здоровья человека.

Связь с заболеваниями

Анализ более 16 000 геномов и почти 7 тысяч метагеномов показал наличие 178 бактериальных кластеров, связанных с раком, диабетом 2 типа, болезнью Крона и язвенным колитом.

При этом один и тот же вид, например Bacteroides uniformis, может одновременно быть связан с разными заболеваниями через разные линии развития.

Как бактерии распространяются

Исследование также показало, что отдельные генетические линии бактерий могут распространяться по миру и сохраняться сотни лет, формируя устойчивые эволюционные ветви.

Некоторые из них обнаруживались у удалённых друг от друга популяций, что говорит о сложных путях передачи микрофлоры между людьми.

Перспективы для медицины

Авторы считают, что диагностика заболеваний и разработка пробиотиков в будущем могут перейти на уровень отдельных генетических линий, а не видов бактерий. Это позволит точнее определять риски и понимать роль микробиома в развитии болезней.

Больше новостей и эксклюзивных видео смотрите в канале Самара Онлайн 24 в MAX.