В кишечнике человека обнаружены следы гигантских бактерий
Бактерии рода Epulopiscium достигают 0,6 мм в длину, что в сотни раз превышает размер обычных бактерий. Ранее их находили преимущественно в кишечнике рыб-хирургов, но теперь микробиологи из Германии выявили следы их ДНК в тысячах образцов микробиома человека из различных стран. Если находку подтвердит микроскоп, это будет свидетельствовать о том, что в организме человека обитают одни из самых крупных бактерий на планете. Об этом пишет портал TechInsider.
Epulopiscium был описан в 1985 году на основе проб из рыб-хирургов Красного моря. Вид E. fishelsoni получил свое название в честь израильского зоолога Льва Фишельсона. Из-за своих размеров бактерию изначально приняли за простейшее, однако в 1993 году анализ рРНК подтвердил, что это именно бактерия. Размножение происходит необычным образом: дочерние клетки развиваются внутри материнской, после чего оболочка последней разрывается. В одной крупной клетке могут содержаться десятки тысяч копий генома.
Обычные бактерии имеют длину около двух микрометров, тогда как гигантскими считаются те, что превышают 10 микрометров. Они обитают в специфических нишах, таких как мангровые заросли или кишечник рыб. Представители рода Epulopiscium могут достигать 600 микрометров, что составляет более половины миллиметра. Их традиционное место обитания — кишечник рыб-хирургов, где они влияют на кислотность среды и активность пищеварительных ферментов.
Дэнни Ионеску из Технического университета Берлина заметил родственные последовательности ДНК Epulopiscium у других видов рыб и решил выяснить их распространенность. Вместе с коллегами он проанализировал данные более чем 600 тысяч микробиомов различных животных из более чем 80 стран. В основном это были данные из открытых баз, а часть образцов собрала команда. В результате были обнаружены десятки тысяч положительных проб у самых разных животных, от моллюсков до хорьков.
Следы Epulopiscium также были найдены в тысячах человеческих микробиомов, чаще всего у детей первого года жизни, а также у людей с воспалительными заболеваниями кишечника и колоректальным раком. Ионеску считает, что эти бактерии не вызывают болезни, а используют нарушенный баланс микробиома. Каждая клетка содержит сотни и даже тысячи хромосом, что обеспечивает им выживание в нестабильной среде. Это может сделать их ранним маркером неблагополучия в кишечнике до появления симптомов. Исследование опубликовано на сервере biorxiv.org.
Биолог Никола Сегата из Университета Тренто полагает, что наличие гигантских бактерий в кишечнике человека стало бы настоящим открытием. По его мнению, поиск по ДНК может выявить другую бактерию с похожими генами, которая может быть даже неизвестной и не обязательно гигантской. Ионеску возражает, утверждая, что даже в этом случае хозяин генов, скорее всего, будет близким родственником Epulopiscium с аналогичной структурой. Группа Ионеску уже ищет бактерий с помощью флуоресцентных зондов, связывающихся с обнаруженными последовательностями ДНК, но окончательным доказательством станет визуализация самой бактерии под микроскопом.
