В МГУ разработали инструмент для контроля ошибок в секвенировании ДНК

Учёные МГУ имени М. В. Ломоносова представили интерактивный веб-сервис NanoporeInspect, который предназначен для контроля качества библиотек ДНК и РНК при нанопоровом секвенировании. Программа анализирует, как распределены искусственно добавленные последовательности — адаптеры, баркоды и другие технические элементы, от корректного расположения которых зависит точность чтения нуклеиновых кислот.

Пользователь загружает в систему файл с результатами секвенирования и указывает набор применяемых служебных фрагментов. Алгоритмы NanoporeInspect сопоставляют прочитанные последовательности с заданными шаблонами и строят интерактивные графики. На них видно, насколько равномерно и корректно присутствуют адаптеры и баркоды, есть ли участки с ошибочным или нерегулярным прикреплением. Это позволяет оперативно выявить сбои подготовки библиотеки: например, неправильную лигировку, некачественные реагенты или нарушения в протоколе.

Особую ценность инструмент имеет для SELEX-экспериментов, где с помощью многократного отбора и усиления ищут молекулы-аптамеры с наилучшими свойствами связывания. В таких исследованиях ошибка на стадии подготовки библиотеки может привести к потере уникальной последовательности, и потому ранний контроль критически важен. В МГУ подчёркивают, что новый сервис даёт возможность оценить качество библиотеки ещё до начала глубокого анализа биологического содержания данных, экономя время и ресурсы.

Разработка выполнена в рамках Научно-образовательной школы МГУ «Мозг, когнитивные системы и искусственный интеллект» и, по оценке авторов, может быть адаптирована под разные протоколы нанопорового секвенирования, что делает её полезной как для фундаментальных исследований, так и для прикладных задач в генетике и биомедицине, сообщает ТАСС.

Обратите внимание: Аномальная зима 2025–2026: Синоптики предупреждают о непредсказуемых сценариях по всей стране