Создан алгоритм для поиска мутаций, связанных с раком кишечника
Российские ученые разработали новый вычислительный метод, который позволяет быстро выявлять изменения в ДНК, способствующие росту опухолей при раке прямой и толстой кишки. Этот алгоритм, по словам специалистов из Центрального университета, ускорит создание новых противораковых препаратов. Об этом рассказывает ТАСС.
Ранее исследователи сталкивались с трудностями в определении генов, активируемых длинными некодирующими РНК, используя метод проб и ошибок. Новый подход позволяет за несколько часов вычислений сформировать список приоритетных генов-мишеней, что значительно упрощает работу онкологов и исследователей.
Ученые отметили, что не только мутации в кодирующих генах, но и изменения в некодирующих участках ДНК влияют на развитие опухолей. Например, длинная РНК SNHG1, количество копий которой увеличивается при раке кишечника, играет важную роль в регуляции активности генов, включая онкогены.
Для решения проблемы поиска мишеней для терапии был предложен алгоритм, который быстро находит новые участки генома, связанные с опухолевым процессом. Метод учитывает взаимодействие ДНК и РНК, а также активность генов и расположение суперэнхансеров, усиливающих работу генов.
С помощью этого алгоритма ученые выявили 12 перспективных генов-мишеней, активность которых повышена в опухолях по сравнению со здоровой тканью. В их числе оказался ген TOP1, уже известный как мишень для химиотерапии рака кишечника. Это подтверждает эффективность нового метода и его потенциал в разработке индивидуализированных терапий.
По данным Всемирного фонда изучения рака, рак прямой и толстой кишки ежегодно диагностируется у более 1,8 миллиона человек, и более половины пациентов умирает в течение пяти лет после постановки диагноза, особенно если заболевание обнаружено на поздних стадиях.
