Генетики расшифровали ДНК плейстоценовой семги
Американские и испанские ученые провели секвенирование древней ДНК из остатков семги, найденных в пещере Эль-Мирон, известном палеолитическом памятнике на Пиренейском полуострове. Геномное исследование показало, что лососи, существовавшие около 18 тысяч лет назад, были ближе к современным популяциям, обитающим в северных регионах, чем в Иберии. Митохондриальный анализ также указал на то, что эффективный размер популяции самок этого вида в ледниковую эпоху был выше, чем у современных рыб в том же регионе. Эти данные представлены в статье, опубликованной в журнале iScience. Об этом сообщает сайт N + 1.
Атлантический лосось (Salmo salar), известный как семга, является одним из крупнейших представителей семейства лососевых. Он обитает в северной части Атлантического океана и в реках, впадающих в него, а также в некоторых северных озерах. Семга сегодня является важным объектом промысла и аквакультуры, что объясняет, почему она стала первым генетически модифицированным животным, разрешенным к продаже и употреблению в Канаде и США.
Несмотря на то, что атлантический лосось все еще встречается в дикой природе, его популяция значительно сократилась за последнее столетие из-за интенсивного промысла и изменений в среде обитания. На юге Европы подгруппы семги оказались на грани исчезновения или вымерли. Пиренейский полуостров, вероятно, служил одним из климатических убежищ для этого вида в ледниковую эпоху. Известно, что первобытные люди уже тогда добывали эту рыбу и использовали ее образ в искусстве.
Даниэль Гарсия-Соуто из Института морских исследований в Виго и его коллеги из Испании и США, включая палеогенетика Дэвида Райха из Гарвардского университета, исследовали популяционную историю атлантического лосося. Они проанализировали остатки рыб, найденные в пещере Эль-Мирон, которая расположена на севере Испании, где также были обнаружены останки кроманьонцев ледникового периода, включая захоронение Красной леди из Эль-Мирона.
Для исследования ученые отобрали позвонки древних рыб, найденные в культурном слое, сформировавшемся между 18,8 и 16,7 тысячи лет назад, во времена мадленской культуры. Генетики секвенировали ДНК из восьми образцов и в семи случаях успешно реконструировали полные митохондриальные геномы, хотя с низкой глубиной покрытия. Также были получены обрывочные данные о ядерных геномах исследованных лососей.
Анализ митохондриальных геномов показал, что особи из Эль-Мирона по материнской линии ближе к лососям из рек Великобритании и Франции, чем к рыбам из реки Асон, рядом с которой находилась пещера с остатками древних особей. Судя по однонуклеотидным полиморфизмам, плейстоценовые лососи с Пиренейского полуострова также генетически ближе к северным популяциям семги, образцы которых происходят с Британских островов и из Норвегии. Ученые оценили эффективный размер популяции самок из Эль-Мирона, который составил около 1548 особей. Для сравнения, у современных лососей из реки Асон он составляет около 731 особи, а из рек Рында и Танаэльв — примерно по 3000 особей.
С глубокой древности добычей лосося и другой рыбы занимались доисторические жители Северной Америки. Недавно ученые проанализировали материалы из археологических памятников на Аляске и обнаружили, что обитатели стоянок ловили налимов как минимум 13 тысяч лет назад, а лососей — не позднее 11,8 тысячи лет назад.
